Le Commandant Shepard, déclaré mort dans les confins des systèmes Terminus est finalement rappelé à servir au péril de sa seconde vie pour le bien de la galaxie. Sans que personne ne lui ait demandé son avis, il revient dans le monde des vivants et devra à nouveau porter la charge de l'univers tout entier sur ses épaules. Une guerre a été démarré et il se doit de la continuer.

Miller Shepard, Commandant au sein de l'alliance interstellaire de l'humanité est amené à remplir son devoir en s'engageant dans une poursuite effréné avec Saren Arterius, un Turien, Spectre renégat, ayant tiré le premier coup de feu dans ce qui s'annonce être la guerre la plus périlleuse que la galaxie ait pu connaître jusqu'ici. ("Rated : M" - Contenu sexuel poussé exclu)