Une réécriture de la saison 3 de Yu-Gi-Oh Link Vrains. Alors que Ai se lamentait de la perte de ses amis, une entité inconnue apparut et lui apporta son aide. De son côté, Yusaku et ses amis se remettent de leurs émotions à la suite de la bataille contre Bohman. Deux mois après cette éprouvante épreuve, sept individus vont surgir de l'ombre et troubler la paix.